Berikut adalah komposisi Tim Pemimpin STFT Jakarta 2023-2027:

Ketua: Pdt. Prof. Binsar Jonathan Pakpahan, Ph.D.

Wakil Ketua 1 Bidang Akademik: Pdt. Agustinus Setiawidi, MA, Th.D.

Wakil Ketua 2 Bidang Administrasi Umum dan Keuangan: Felix John Lawalata

Wakil Ketua 3 Bidang Kemahasiswaan: Pdt. Rahel Sermon Harapani Daulay, S.Si., M.L.M.

Wakil Ketua 4 Bidang Relasi Publik: Pdt. Justitia Vox Dei Hattu, Th.D.

Formator Spiritual Ekumenis: Pdt. Ester Pudjo Widiasih, Ph.D.

Ketua Program Studi S-1: Pdt. (em.) Dr. Rasid Rachman

Ketua Program Studi S-2: Erich von Marthin Hutahaean, Ph.D.

Ketua Program Studi S-3: Pdt. Simon Rachmadi, Ph.D.