Berikut adalah komposisi Tim Pemimpin STFT Jakarta 2023-2027:

Ketua: Pdt. Prof. Binsar Jonathan Pakpahan, Ph.D.

Wakil Ketua 1 Bidang Akademik: Pdt. Agustinus Setiawidi, MA, Th.D.

Wakil Ketua 2 Bidang Administrasi Umum dan Keuangan: Felix John Lawalata

Wakil Ketua 3 Bidang Kemahasiswaan: Pdt. Rahel Sermon Harapani Daulay, M.L.M., D.W.S.

Wakil Ketua 4 Bidang Relasi Publik: Pdt. Justitia Vox Dei Hattu, Th.D.

Formator Spiritual Ekumenis: Pdt. Ester Pudjo Widiasih, Ph.D.

Kepala Lembaga dan Ketua Program Studi

Kepala Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat (LPPM): Pdt. Prof. Joas Adiprasetya, Th.D.

Kepala Lembaga Penjaminan Mutu (LPM): Pdt. Yusak Soleiman, Ph.D.

Ketua Program Studi Sarjana Sains Teologi (Filsafat Keilahian): Pdt. (em.) Dr. Rasid Rachman

Ketua Program Studi Magister Teologi: Erich von Marthin Hutahaean, Ph.D.

Ketua Program Studi Doktor Teologi: Pdt. Simon Rachmadi, Ph.D.